| ・五辻殿址 | 上京区五辻通千本東入北側 | |
| ・宴松原 | 上京区七番町 | |
| ・蔵人町屋跡 | 上京区下立売通浄福寺西入北側 | |
| ・検非違使庁址 | 上京区葭屋町通出水上る西側 | |
| ・清和院并土御門内裏址 | 上京区室町通中長者町下る東側 | |
| ・待賢門跡 | 上京区猪熊通下立売下る西側 | |
| ・大極殿遺址碑 | 上京区千本通丸太町上る西側(内野児童公園内) | |
| ・土御門内裏跡 | 上京区烏丸通下長者町上る西側(京都ガーデンパレス前) | |
| ・土御門内裏跡 | 所在不明(上京区烏丸通下長者町上る京都ガーデンパレス前カ) | |
| ・平安宮大蔵省跡 | 上京区中立売通裏門西入南側 | |
| ・平安宮内裏宜陽殿跡 | 上京区浄福寺通下立売上る東側 | |
| ・平安宮一本御書所跡 | 上京区下立売通智恵光院西入北側 | |
| ・平安宮内裏弘徽殿跡 | 上京区土屋町通出水下る東入北側 | |
| ・平安宮内裏承香殿跡 | 上京区浄福寺町通出水下る西入北側 | |
| ・平安宮内裏承明門跡 | 上京区下立売通浄福寺西入南側 | |
| ・平安宮内裏昭陽舎跡 | 上京区浄福寺通出水下る東入北側 | |
| ・平安宮内裏内郭回廊跡 | 上京区下立売通土屋町西入南側 | |
| ・平安宮内裏綾綺殿跡 | 上京区浄福寺通下立売上る東側 | |
| ・平安宮主水司跡 | 上京区丸太町通日暮西入南側 | |
| ・法成寺址 | 上京区荒神口通寺町東入北側 | |
| ・蘭林坊跡 | 上京区土屋町通出水上る東側 |
| ・延勝寺跡 | 左京区岡崎成勝寺町(疏水畔) |
| ・延勝寺跡 | 左京区岡崎成勝寺町(京都市勧業館内) |
| ・円勝寺跡 | 左京区岡崎成勝寺町 |
| ・最勝寺跡 | 所在不明(左京区岡崎最勝寺町カ) |
| ・白河北殿址 | 左京区丸太町通東大路西入南側(京都大学熊野寮内) |
| ・白河南殿跡 | 左京区聖護院蓮華蔵町 |
| ・成勝寺跡 | 左京区岡崎成勝寺町(京都市勧業館内) |
| ・尊勝寺跡 | 左京区岡崎最勝寺町(京都会館前) |
| ・得長寿院跡 | 左京区岡崎徳成町 |
| ・法勝寺九重塔址 | 左京区岡崎法勝寺町(京都市動物園内) |
| ・大炊御門万里小路殿址 | 中京区富小路通夷川上る西側 | |
| ・烏丸御池遺跡・平安京跡 | 中京区烏丸通御池北東角 | |
| ・閑院内裏址 | 中京区押小路通小川西北角 | |
| ・勧学院址 | 中京区西ノ京勧学院町 | |
| ・弘文院址 | 中京区御池通千本東入北側 | |
| ・三条烏丸御所跡 | 中京区三条通烏丸西入南側 | |
| ・三条東殿遺址 | 中京区姉小路通烏丸東入南側(新風館前) | |
| ・四条坊門小路跡 | 中京区壬生馬場町(壬生坊城団地前) | |
| ・奨学院址 | 中京区西ノ京南聖町 | |
| ・神泉苑東端線 | 中京区押小路通大宮交叉点北側(二条城堀端) | |
| ・神泉苑西端線 | 中京区押小路通美福東入北側(二条城堀端) | |
| ・朱雀院跡 | 中京区壬生花井町(日本写真印刷中央研究所内) | |
| ・大学寮址 | 中京区西ノ京北聖町 | |
| ・高松殿址 | 中京区姉小路通釜座東入北側(高松神明社前) | |
| ・二条富小路内裏址 | 中京区富小路通夷川下る西側(京都府中京庁舎前) | |
| ・平安宮西限藻壁門跡 | 中京区西ノ京左馬寮町(朱雀第二小学校内) | |
| ・平安宮跡豊楽院跡 | 中京区聚楽廻西町 | |
| ・平安宮朝堂院跡 | 中京区丸太町通千本西入北側 | |
| ・平安宮豊楽殿跡 | 中京区聚楽廻西町 | |
| ・平安宮造酒司倉庫跡 | 中京区丸太町通七本松西入北側(京都アスニー内) | |
| ・平安宮造酒司倉庫跡 | 中京区丸太町通七本松西入北側(京都アスニー内) | |
| ・平安京朱雀大路と朱雀門 | 中京区西ノ京栂尾町(ＪＲ二条駅東口) | |
| ・平安京大内裏朱雀門址 | 中京区西ノ京小堀町 | |
| ・堀河天皇里内裏跡 | 中京区堀川通二条下る東側(京都国際ホテル前) | |
| ・冷然院跡 | 中京区竹屋町通堀川西入(二条城北側) |
| ・法住寺殿蹟 | 東山区三十三間堂廻り(法住寺門前) |
| ・法住寺殿址 | 東山区三十三間堂廻り(三十三間堂内) |
| ・東鴻臚館址 | 下京区西新屋敷揚屋町(角屋前) |
| ・教王護国寺境内 | 南区九条町(東寺東門前) |
| ・西寺阯 | 南区唐橋西寺町(西寺児童公園内) |
| ・西寺大炊殿跡 | 南区唐橋西寺町 |
| ・西寺旧跡 | 南区唐橋平垣町(西寺前) |
| ・綜芸種智院蹟 | 南区西九条池ノ内町(西福寺前) |
| ・平安京東洞院大路東側溝跡 | 南区東九条南山王町(京都市南図書館内) |
| ・羅城門遺址 | 南区唐橋羅城門町(花園児童公園内) |
| ・桓武天皇勅営角倉址・了以翁邸址・平安初期鋳銭司旧址 | 右京区嵯峨天龍寺角倉町(公立学校共済組合嵐山保養所花のいえ前) |
| ・淳和院跡 | 右京区西院高山寺町(高山寺前) |
| ・白河法皇・鳥羽法皇院政地 | 伏見区竹田浄菩提院町 |
| ・鳥羽殿跡 | 伏見区中島前山町(鳥羽離宮跡公園南側) |
| ・鳥羽離宮金剛心院跡 | 所在不明(伏見区竹田東小屋ノ内町カ) |
| ・鳥羽離宮田中殿跡 | 伏見区竹田田中殿町(田中殿公園内) |